Оцените презентацию от 1 до 5 баллов!
Тип файла:
ppt / pptx (powerpoint)
Всего слайдов:
35 слайдов
Для класса:
1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11
Размер файла:
3.81 MB
Просмотров:
54
Скачиваний:
0
Автор:
неизвестен
Слайды и текст к этой презентации:
№1 слайд
Содержание слайда: Моделирование регуляции развития меристемы побега в эмбриогенезе Arabidopsis thaliana
Научный руководитель:
к.б.н., доц. Лихошвай В. А.
Докладчик:
асп. ИЦиГ Акбердин И. Р.
3 год аспирантуры
Лаборатория теоретической генетики
Сектор молекулярной эволюции
Специальность:
03.00.28 – биоинформатика
Тема утверждена:
Учёный совет, протокол №11 от 07.05.08
Межлабораторный семинар, протокол №5 от 11.04.08
№2 слайд
№3 слайд
Содержание слайда: Меристема побега Arabidopsis thaliana:
№4 слайд
№5 слайд
Содержание слайда: Цель и задачи исследования:
№6 слайд
Содержание слайда: Накопление и транспорт ауксина:
№7 слайд
Содержание слайда: Химические структуры веществ, обладающих активностью ауксина:
№8 слайд
Содержание слайда: Метаболизм ауксина:
№9 слайд
Содержание слайда: Конъюгация ауксина:
№10 слайд
Содержание слайда: Структурная модель генной сети метаболизма ауксина*:
№11 слайд
Содержание слайда: Структурная модель генной сети метаболизма ауксина:
№12 слайд
Содержание слайда: Структурная модель генной сети метаболизма ауксина:
№13 слайд
Содержание слайда: Редуцированная структурная модель генной сети метаболизма ауксина:
№14 слайд
Содержание слайда: MGSgenerator: блок автоматической конвертации формата ГС в формат моделей:
№15 слайд
Содержание слайда: MGSmodeller: Компьютерная система для конструирования, расчета и анализа моделей молекулярно-генетических систем:
№16 слайд
Содержание слайда: Результаты моделирования процентного содержания различных форм ауксина в клетке меристемы побега:
№17 слайд
Содержание слайда: Результаты моделирования динамики изменения концентрации ИУК и GH3 белка в клетке
в зависимости от начальной концентрации:
№18 слайд
Содержание слайда: Результаты моделирования динамики изменения концентрации ИУК-аланин в норме и при мутациях (trp2,trp3):
№19 слайд
Содержание слайда: Эмбриональное развитие
меристемы побега Arabidopsis Thaliana
№20 слайд
Содержание слайда: Разработка пространственно – распределённой модели:
Основные принципы:
Клетки автомата могут обмениваться химическими сигналами. Было выбрана 3 типа сигналов имеющих биологический смысл:
стволовой сигнал (SS);
сигнал дифференцировки (SD);
базальный сигнал (BS);
Все клетки разделены на несколько типов в зависимости от типа продуцируемого ими сигнала, причем клетки могут менять свой тип;
Тип клетки и продолжительность клеточного цикла зависят от локальной концентрации сигналов;
Направления деления зависят от градиентов распределения сигналов.
№21 слайд
Содержание слайда: Типы клеток автомата:
Промеристем - клетки меристемы зародыша. Эти клетки продуцируют SS и находятся в верхней части зародыша. В процессе развития эти клетки переходят в клетки типа Л2меристеми Л3меристем.
Л2меристем - клетки меристемы, находящиеся во втором слое (считая от эпидермального слоя) верхней части зародыша. Эти клетки продуцируют SS.
Л3меристем - клетки, находящиеся на слой ниже клеток типа Л2меристем. Так же продуцируют SS.
Транзитные - клетки, находящиеся вблизи меристемы. Они так же продуцируют низкий SD, но имеют самый высокий темп деления.
Латеральные - клетки этого типа имитируют «дифференцированные» клетки, которые продуцируют SD.
Суспензорные - клетки суспензора. Эти клетки продуцируют BS и располагаются в нижней части зародыша. В модели их всегда две.
№22 слайд
Содержание слайда: Внутренние параметры «клетки» модели:
Type – тип клетки
BS0, SS0, SD0 – значения сигналов продуцируемых данной клеткой.
BS, SS, SD – значения сигналов с учетом влияния всей ткани.
K – отношение стволового сигнала к сигналу дифференцировки, K=SS/SD.
T – продолжительность клеточного цикла, T=T(K).
Tp – возраст клетки считая от последнего деления.
№23 слайд
Содержание слайда: Темпы делений
клеток меристемы побега:
№24 слайд
Содержание слайда: Взаимодействие «клеток» модели:
Глобальное взаимодействие
№25 слайд
Содержание слайда: Визуализация модели
клеточного автомата:
№26 слайд
№27 слайд
Содержание слайда: Результаты моделирования.
Мутантное развитие зародыша:
№28 слайд
Содержание слайда: Анализ чувствительности модели к параметрам транспорта и синтеза SD (сигнала дифференцировки):
№29 слайд
Содержание слайда: Анализ чувствительности модели к параметрам транспорта и синтеза SD (сигнала дифференцировки):
№30 слайд
Содержание слайда: Распределение паттернов ауксина
в развивающейся апикальной меристеме побега:
№31 слайд
Содержание слайда: Распределение паттернов ауксина
в развивающейся апикальной меристеме побега:
№32 слайд
№33 слайд
№34 слайд
№35 слайд
Содержание слайда: Благодарности: