Оцените презентацию от 1 до 5 баллов!
Тип файла:
ppt / pptx (powerpoint)
Всего слайдов:
17 слайдов
Для класса:
1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11
Размер файла:
5.83 MB
Просмотров:
56
Скачиваний:
0
Автор:
неизвестен
Слайды и текст к этой презентации:
№1 слайд
Содержание слайда: Прохождение курса «Биотехнологии: генная инженерия» – источник дополнительных баллов
№2 слайд
Содержание слайда: Лекция 3 Методы чтения нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей
Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот
Секвенирование геномов древних людей
№3 слайд
Содержание слайда: Методы прочтения последовательностей нуклеиновых кислот
№4 слайд
Содержание слайда: Секвенирование ДНК по Сэнгеру
№5 слайд
Содержание слайда: Высокопроизводительное секвенирование
№6 слайд
Содержание слайда: Задачи решаемые высоко-производительным секвенированием
Определение последовательности всех хромосом организмов – секвенирование генома
Определение последовательности геномов сообщества организмов – секвенирование метагенома
Определение последовательности всех кодирующих областей генов - секвенирование экзома
Определение последовательностей всех транскриптов (мРНК, некодирующих РНК и т.д.) - секвенирование транскриптома
Выявление мутаций в раковых геномах конкретных людей персонализированная медицина
Определение дифференциально экспрессированных генов в масштабе транскриптома
№7 слайд
Содержание слайда: Виды секвенируемых нуклеиновых кислот
№8 слайд
Содержание слайда: Создание библиотек для секвенирования общие технологические шаги
№9 слайд
Содержание слайда: Технология секвенирования на примере платформы Illumina
№10 слайд
Содержание слайда: Серьезный недостаток высоко-производительного секвенирования : по концам ридов накапливаются ошибки чтения из-за неполноты химических реакций
№11 слайд
Содержание слайда: Анализ данных секвенирования
Очистка данных:
Удаление последовательностей адапторов
Удаление ненадежно прочитанных концов ридов
Удаление слишком коротких ридов
Контроль качества ридов.
Картирование ридов на референсную последовательность или сборка последовательностей de novo.
Статистический анализ.
№12 слайд
Содержание слайда: Археогенетика
Область исследований молекулярной генетики, в которой методы популяционной генетики применяются к изучению истории человечества.
Термин предложен британским археологом Колином Ренфрю
Ключевой метод: анализ ДНК, полученной из археологических останков (древней ДНК, англ. aDNA);
№13 слайд
Содержание слайда: Сложности секвенирования древней ДНК
Высокая степень фрагментации (50 нт)
Высокая степень конверсии оснований:
С U (дезаминирование цитозина с превращением в урацил)
5mC T (дезаминирование 5-метил цитозина с превращением в тимин)
A Xyp (дезаминирование аденина в гипоксантин)
Алкилирование оснований
Поперечные сшивки оснований
Вставки митохондриальной или пластидной ДНК
Большая доля примесей ДНК микроорганизмов
№14 слайд
Содержание слайда: Секвенированные геномы древних людей: неандерталец
№15 слайд
Содержание слайда: Гены, отличающие современного человека от неандертальца
№16 слайд
Содержание слайда: Секвенированные геномы древних людей: денисовский человек
№17 слайд
Содержание слайда: Реконструкция происхождения Homo sapiens по последовательности митохондриальной ДНК